股权转让一般是涉及到的是所得税和印花税，根据转让方是个人还是公司有所区别!特殊情况下也会涉及到增值税及附加税。下面我们来详细说明下。
一、所得税
1、如果转让方为企业，则缴纳企业所得税：
根据《国家税务总局关于贯彻落实企业所得税法若干税收问题的通知》(国税函〔2010〕79号)规定：三、关于股权转让所得确认和计算问题企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现。转让股权收入扣除为取得该股权所发生的成本后，为股权转让所得。企业在计算股权转让所得时，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额。
企业所得税的税率为25%，符合小型微利企业等其他条件的，可享受企业所得税相关优惠。
2、如果转让方为个人，则缴纳个人所得税：
个人转让持有的公司股权，按税法相关规定，应由转让方个人缴纳个人所得税，受让方是代扣代缴义务人。税率为20%。
以股权转让价款减去取得股权时的原值和相关合理费用后的余额作为应纳税所得额计征。即：应纳税所得额=股权转让收入-股权原值-合理费用。
这里的合理费用就是股权转让过程中发生的审计费、资产评估费、印花税等必要费用，这个影响较小，应纳税所得额主要看转让收入和股权原值。对于新成立公司，一般看股权价格和注册资本份额的关系，对于持续经营期公司，通常看股权价格和净资产份额的关系，溢价转让就要交纳个税、平价或折价转让就不需要交纳个税。
如：自然人甲与乙公司合资成立丙公司，甲实际出资30万元，乙公司实际出资70万元。经营2年后，公司留存收益200万元。现自然人甲将其全部股权转让给丁，假如按甲持股比例对应的丙公司净资产份额计算股权转让价：(100万元+200万元)*30%=90万元。股权转让花费股权评估费1万元。甲转让股权应缴纳的个人所得税为：
个人所得税为=(90万元-30万元-1万元)*20%=11.8万元。
如股权转让双方约定的股权转让价过低、或者零元转让，税务机关可以进行核定征收。
税务机关一般按转让股权所对应的公司净资产额，进行核定股权转让收入以征收个人所得税。按税法相关规定，低价甚至零元转让公司股权，并不能免征个人所得税。
个人股东欲低价转让公司股权以免征个人所得税时，应特别慎重，须判断低价转让是否有税务机关认可的合理理由，否则，转让后将面临税务机关核定转让收入、补缴个人所得税的风险。
二、印花税
根据《中华人民共和国印花税暂行条例》(国务院令第11号)第二条规定：下列凭证为应纳税凭证：“…… 2.产权转移书据；”
根据其附件《印花税税目税率表》规定：“产权转移书据包括财产所有权和版权、商标专用权、专利权、专有技术使用权等转移书据。立据人按所载金额万分之五贴花。”
根据《印花税暂行条例施行细则》第十六条规定，产权转移书据由立据人贴花，如未贴或者少贴印花，书据的持有人应负责补贴印花所立书据以合同方式签订的，应由持有书据的各方分别按全额贴花。
综上，转让双方均应按照所立书据上的金额的万分之五计算缴纳印花税。
三、增值税
1、如果转让方为企业
企业转让上市公司股票应按转让金融商品的相关规定缴纳增值税，转让非上市公司股权目前暂不征收增值税。
根据《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》(财税〔2016〕36号)附件1 销售服务、无形资产、不动产注释：“一、销售服务(五)金融服务 4.金融商品转让：金融商品转让，是指转让外汇、有价证券、非货物期货和其他金融商品所有权的业务活动。其他金融商品转让包括基金、信托、理财产品等各类资产管理产品和各种金融衍生品的转让。”
根据(财税〔2016〕36号)附件2规定：“一、(三)销售额3.金融商品转让，按照卖出价扣除买入价后的余额为销售额。转让金融商品出现的正负差，按盈亏相抵后的余额为销售额。若相抵后出现负差，可结转下一纳税期与下期转让金融商品销售额相抵，但年末时仍出现负差的，不得转入下一个会计年度。金融商品的买入价，可以选择按照加权平均法或者移动加权平均法进行核算，选择后36个月内不得变更。金融商品转让，不得开具增值税专用发票。一般纳税人金融商品转让税率6%，小规模纳税人为3%。
如果企业转让非上市公司股权，不属于金融商品转让，不是增值税征收范围，不缴纳增值税。
2、如果转让方为个人
个人转让上市公司股票免征增值税，转让非上市公司股权目前暂不征收增值税。
根据财税[2016]36号附件3规定：“一、(二十二)、5.个人从事金融商品转让业务免征增值税。
四、附加税费
如果属于金融商品转让，需要缴纳增值税，则需根据实际缴纳的增值税缴纳1、城市维护建设税：城市市区：7%，县城、镇：5%，其他：1%(根据区域三选一)；2、教育费附加：3%；3、地方教育附加：2%。
如果转让非上市公司股权，不属于金融商品转让，不是增值税征收范围，不缴纳增值税，也不需缴纳上述附加税费。
